とんでもなく巨大なものが銀河系に接近。　これが近づくと全エネルギーが吸収され、宇宙ステーションも惑星も停電壊滅状態になってしまう。　どうやらこれは、絶滅したクジラを祖先とする生命体らしい事が判明。　カーク達は壁がきしむ程の超ワープで２０世紀の地球＝観客の世界に向かう！　　前編『スタートレック３』でとんでもない大技（ネタバレのため割愛）を使い、宇宙に取り残されてしまったカーク船長御一行が、宇宙船エンタープライズ号抜きで活躍する物語。