《第一部》関が原の合戦に破れ故郷に戻った武蔵（高橋英樹）は、年増女とともに姿を消した親友又八（フランキー堺）の許婚お通（松坂慶子）と逃げるように村を出た。武蔵と別れて三年、お通は京都の吉岡道場の当主清十郎（細川俊之）と武蔵が果し合いをすることを知った。《第ニ部》数々の剣豪を破り、江戸で柳生一門に挑んだ武蔵だが、その剣は武道にあらぬ殺生剣、と試合を拒否され己の未熟さを悟るのだった。仕官先として小倉藩細川家に推薦された武蔵は藩主忠利（浜畑賢吉）の面前で宿敵、佐々木小次郎（田宮二郎）と対面する。剣に迷いを感じていた武蔵は故郷の恩師の沢庵和尚（笠智衆）を訪ね、そこで出家した又八と再会する。（136分/カラー）