昭和２０年、日本は連合国側と有利な条件で和平を結ばんと秘密裏に作戦を立てた。マレー半島に配属されていた潜水艦イ−５７の艦長・河本（池部良）は、某国の外交官父娘をスペイン・カナリヤ諸島まで無事に送り届けよという命令を受け出発する。途中幾度と無く敵艦と遭遇しながらも危機を脱し、一路大西洋を目指すイ−５７。しかしその間に戦局は悪化しついに大本営は作戦を放棄するが、イ−５７にはそれが伝わらないままになっていた……。