昭和75年の東京。湾岸周辺にて作業中のレイバー（作業用の工作重機で、主に人型の形状の物が多い）が何者かに襲われる事件が発生した。湾岸開発に反対する環境保護団体の仕業か？企業を狙ったテロか？…様々な憶測の中、捜査を開始した警視庁城南署の刑事・久住（CV：綿引勝彦）と秦（CV：平田広明）は、つい先日東京湾に米貨物機が墜落したことと、それ以来周辺海域にて異常に成長した魚介類が発見されていることを突き止める。…そしてそんな彼らを待ち受けていたのは…。『機動戦士ガンダム0080　ポケットの中の戦争』の高山文彦が総監督を務めた、劇場用シリーズ第３作。（本篇100分）