アメリカCBSネットワーク人気TVシリーズ『スパイ大作戦』をトム・クルーズ主演で映画化。今回の指令は東欧に潜入中のCIA情報員のリスト「NOC」を盗んだプラハの米大使館員ゴリツィンと情報屋を逮捕する事。任務の為にイーサン・ハント(トム・クルーズ：鈴置洋孝)らIMFのメンバーは大使館に向かうが・・・。