1943年。かつてジョン＝エンダーズ(ニコラス＝ケイジ)率いる海兵隊部隊は日本軍の猛攻を受け、彼一人だけが生き残った。自分を恨んで死んでいった戦友達に対しての責任を感じるエンダーズは一刻も早い復隊を希望する。ようやく復隊が認められたエンダーズに課せられた新たな任務は、“ウインドトーカーズ”と呼ばれたナヴァホ族の通信兵カール＝ヤージー(アダム＝ビーチ)を護衛し、彼の戦場での安全を確保することだった。しかし、実は真に必要とされたのは暗号の秘密の死守で、もし彼が捕虜となるような事態に陥ったなら、暗号保持のため、彼を殺すことも指令に含まれていた。最前線で戦う彼らには、やがて友情が芽生えていくのだが…