ジャングルの奥地でオオカミに育てられた人間の子供、モーグリ（ニール・セティ）は、オオカミの群れのリーダーアキーラ（ジャンカルロ・エスポジト）の庇護と母親代わりの雌オオカミ、ラクシャ（ルピタ・ニョンゴ）の愛情を受け、しあわせに暮らしていた。ジャングルには雨季が終わり、長い乾季が訪れたが、川の水が干上がって「平和の岩」が発見されたことで、「水の休戦」が始まる。そこでは常日頃食べる側の動物も、食べられる側の動物も平和なひとときを過ごすのだ。しかしそこに人間に深い憎悪を抱くトラのシア・カーン（イドリス・エルバ）が戻ってきた…