2013年4月15日。パトリオットデイ(愛国者の日)に開催されたボストンマラソン大会のゴール近くで、突然に爆破テロが発生し、多くの観客らが死傷した。付近で警備をしていたボストン警察の巡査部長のトミー(マーク・ウォールバーグ)は、傷ついた人々の移送や逃げ惑う観客やランナー達の誘導に奔走するが、自分達の無力さに、憤りと無念さを感じていた。やがてFBIのデローリエ捜査官(ケヴィン・ベーコン)らが到着し、地元警察と協力し、事件の分析と捜査を始めるが、やがて防犯カメラに映る不審な二人組が浮上する…。