突如世界各地に、いにしえのTVゲーム『ゼビウス』の大型空母が現れ、街を襲う。迎え撃つ宇宙戦隊キュウレンジャー。だが、相手の攻撃力が上回り、ホワイト・タイガー（アム）は負傷し、ライダーの勤務する聖都大学病院に運び込まれる。アムを迎えに来たキュウレンジャーたちは、ゲームの世界が現実を攻撃する黒幕はポッピーピポパポに違い無いとし、捕獲を図る。それを阻止せんとするライダーたち。しかし、敵の意図はまったく別のところにあった…。仮面ライダーとスーパー戦隊が闘い、共闘するスーパーヒーロー大戦シリーズ第5弾。