遺伝子に異変をきたしているヘンリー（エリック・バナ）は‘時の旅人。そして、そんな不可知な存在であるヘンリーを物心ついた時から愛しているクレア（レイチェル・マクアダムス）は、過去、現在、未来を自分の意志とは関係なく移動してしまうヘンリーに戸惑いながらも二人は結ばれる。しかし、愛し合う時は束の間、いつしかヘンリーに死の影が訪れて・・・