17歳になったジェシー(ジェイソン・ジェームズ・リクター)は、夏休みを利用してシャチの群れの調査をするバイトをする。シャチの減少区域に向かった彼は、久々にシャチのウィリーと再会。しかしその一帯では、日本人へ売るために悪質な密猟者がウィリーたち――シャチを狙っていた。