超人類カーンの逆襲を辛くも退けたUSSエンタープライズだが、その代償はあまりにも大きかった。…だが、帰還したクルー達を待っていたのは意外な知らせだった。今や全銀河系の注目を集める新惑星ジェネシスで、非常に強い生命反応が探知されたのである。…かの地には「彼」が眠る…命令を無視し、反逆者としての汚名も省みず出撃するカーク艦長（ウィリアム・シャトナー）たちであったが、彼らの前には連邦艦隊の新造戦艦エクセルシオールの追撃と、「ジェネシスシステム」の兵器としての価値に感づいたクリンゴン艦隊が待ち受けていた…。「スポック」役のレナード・ニモイが監督を務めた、人気ＳＦシリーズ劇場版第３作。（本篇105分）