ボストンの昼下がり。突然心臓にペースメーカーを付けた人たちが、次々に亡くなる事件が発生。そして鳥たちがいきなり暴れだしたり、帰還中のスペースシャトルの誘導装置が誤作動を起こすなど、世界中で異常な現象が続出。シカゴ大学のキーズ博士（アーロン・エッカート）は電磁波のせいではと推理するうち、地球の核＜コア＞が回転を停止したためという結論にたどり着く。このままでは太陽風や放射線を防ぐ磁場が消滅し、一年以内に人類は滅亡するという。そこで米国国防省や、ジムスキー博士（スタンリー・トゥッチ）らの協力の下、核をふたたび回転させようと、ある計画を立てるのだった。