不思議な石器時代に住む、家族ぐるみで仲の良いフレッド・フリントストーン（ジョン・グッドマン）とバーニー・ラブル（リック・モラニス）。 バーニーと妻のベティは養子を迎え入れたかったのだが、財産がない。 そこで、フレッドが自分のお金を渡してくれて無事、二人は子供を養子にもらえ、彼はいつか恩返ししようと心に決めた。 そんなある日、会社の昇進試験に挑んだ二人なのだが、フレッドの答案石版は真っ白。 それをみかねた、バーニーが、自分の石版と交換する。 そして結果は、フレッドは最高得点で重役に、逆にバーニーは０点でクビに。 得意満面なフレッドだが、実は副社長とその秘書の悪巧みにまんまと利用されていて・・・ アニメの実写版。