高校生のコーディ・バンクス（フランキー・ムニッズ）は、女の子に告白をしようとするたびに、アガってしまい何もいえなくなるほどのシャイな男の子。そんな彼には家族も知らないもう一つの顔が。それはＣＩＡのジュニア・エージェントということ･･･。そんな彼に初めての任務が。それは悪いやつらに利用された天才科学者がすすめる発明を調査し、陰謀を阻止するために、科学者の一人娘のナタリー（ヒラリー・ダフ）をクドくこと･･･。