コーラルシティに住むオスカー（ウィル・スミス・声）は、「ホエールウォッシュ」で働く小魚だが、「いつかはシティ一番の有名な魚になってやる」という野望を持っていた。そんな彼の側に、彼を熱く見つめる視線があるのすら気づかないまま･･･。ある日、サメのくせに「ベジタリアン」だという心優しいレニー（ジャック・ブラック・声）になんとか魚を食わせようと、兄のフランキーがトレーニングをしようとするなさか、船のイカリがフランキーを直撃し、死んでしまう。たまたまそばにオスカーがいたため、オスカーは突然「シャーク・キラー」として、シティ一番の人気者になってしまう･･･。