あの恐ろしい立方体空間「ＣＵＢＥ」がまた帰ってきた。新たな謎を秘めて･･･。一人の男がまた、ＣＵＢＥのトラップに嵌り命を落とした。その様子をモニターで見つめる男が二人。彼らは「監視者」で、ＣＵＢＥの中の様子をただ黙々と見つめ、報告していた。そして彼らもこのＣＵＢＥが何の為に存在しているのか全く知らなかった。ある日、新しい「被験者」の女性が立方体の中で目を覚ます。彼女が気になった監視者ウィン（ザカリー・ベネット）は、同僚に黙って、彼女を救おうと、立方体の中に足を踏み入れるが･･･。