1600年代初頭。英国を出発した船が、アメリカ大陸（今のヴァージニアあたり）に到着した。そこには先住民たちが暮らしていた。船長はスミス（コリン・ファレル）に先住民たちとの交渉を任せ、開拓の準備のために本船は英国へ戻ってしまった。残されたスミスたちは、過酷な条件の中でアメリカ大陸で暮らさねばならなかったが、先住民たちとの諍いのなか、スミスは捕らえられてしまった。処刑寸前に王の末の娘ポカポンタス（クオリアンカ・キルヒャー）の懇願で命を救われたスミスは、ポカポンタスと交流を深め、次第に二人は愛し合うようになるが、運命は二人の愛を許さなかった･･･。