南太平洋に古代ケロンの巨大人型兵器・キルルが現われて船舶が危機に陥るが、「海の妖精」ふたりによって粉砕される。一方、ケロロ軍曹（渡辺久美子）は、飼い主の冬樹（川上とも子）の学友・桃華（池澤春菜）が発見したＵＭＡの子供をめぐり、その秘密を探るべく（？）仲間達とともに南太平洋に旅立った。そこに同行した冬樹の姉・夏美（斎藤千和）は、謎の海洋生物に襲われ、海底へと連れ去られる。彼女を迎えた海底帝国のプリンス・メール（桑島法子）は夏美をプリンセスと呼び、彼女のための城と、彼女の思い出に残る町を一瞬にして創り上げた。あまりのことに途惑う夏美だった…。〔78分/カラー/ヴィスタ〕