ある夜、ミシェルは車を運転中に、突然事故にあう･･･。目が覚めると、そこは閉ざされた部屋。そこはハワード（ジョン・グッドマン）が作った「シェルター」の中。もうひとり、エメットという若い男と３人だけ、外界と隔絶された部屋の中に閉じ込められた。ハワードがいうには、外では何者かの攻撃により汚染され、死の世界と化したのだと。３人での共同生活が始まったが、俄かに信じがたい話に、ミシェルは脱出の機会をうかがっていた。ある日、スキをみてシェルターの出口まで行くが、その窓の外で彼女が見たものは･･･。