「一年戦争」は終結し、サイコザクでガンダムを圧倒したジオン軍のダリル（木村良平）は残党に身を置き地球で偵察行に参入していた。地球連邦の構成国家である「南洋同盟」が密かにサイコザクのデータを盗み、再現を試みようとしているのだ。一方、ジオンより解放された連邦軍のイオ（中村悠一）も密命を受けて「アトラスガンダム」とともに南洋に向かう。明朗ながら冷静な判断力をもつ新たな相棒、ビアンカ（古川由利奈）を得たイオだが、自分がなぜこの作戦に投入されたかを語る者は現われなかった。判ることは、烏合の衆に等しかった南洋同盟を統率、軍事国家に作り替えた裏切者がいるという事実だった。地上に舞台を移したシリーズ続編。〔89分〕