南海の孤島・ゾルゲルでは、気候を自由に操作する為の第一歩となる「シャーベット計画」が国連の科学者達の手で行われようとしていたが、何物かの妨害電波を受け実験は失敗。数日間の異常気象の後に科学者達が見たものは、その影響で巨大化したカマキリの群れであった。島を我が物顔で闊歩する巨大カマキリ＝カマキラスは巨大な卵を掘り出すが、やがて卵からは小さな怪獣ミニラが孵化した。そこへゴジラがやってきて、カマキラスを撃退。いつしか親子の様になったゴジラとミニラだったが、そんな中科学者達は、最後の賭けとして再度シャーベット計画を実行に移した……。