現実世界の歪みを吸収する反転世界でギラティナとディアルガが戦っていたとき、感謝ポケモン、シェイミ（山崎バニラ）が余波に巻き込まれ現実世界に放り出された。そして、旅途上のサトシ（松本梨香）やピカチュウ（大谷育江）一行と合流するのであった。シェイミはテレパシーでサトシたちに花畑に連れて行くよう頼む。出立した一行。しかし、不意に現れた反転世界の入り口に彼等は引き込まれてしまうのだが…。「ダイヤモンド＆パール」シリーズ第２作。