1999年…あれから5年後の米メリーランド州バーキッツヴィル。映画『ブレア・ウィッチ・プロジェクト』の大ヒットで、この田舎町はブレアの魔女目当てに全世界から観光客が訪れる一大人気スポットとなっていた。地元の青年スティーブン（スティーブン・バーカー・ターナー）は、観光客目当てに「ブレア・ウィッチ・ハント」ツアーを開催する。最新ビデオ機器で魔女の姿を捉える目論見だったのだが…森の中で夜通し起きているつもりのはずが、なぜか全員が気絶してしまい、朝になると荷物がメチャメチャに荒らされていた。かろうじで無事だった撮影済のテープを持ち、一行は森を去るのだが…。大ヒットしたオカルトホラーの続編。（本篇90分）