ドキュメンタリー制作者の私光石研は、ある性同一性障害の少年本多一麻に興味を持ち、自らユダと名付けて彼の日常をビデオカメラで撮り始める。しかし、ユダは私のビデオカメラとともに突然行方をくらましてしまう。ある日、心身に障害を持つ美智と名乗る女岡元夕紀子が現われ、「ユダは死んだ」と告げられる。その帰り道、事故に遭い病院に搬送された美智を見舞った私は、彼女の口から、彼女とユダ、そして知的障害のタイチ三浦誠己を交えた3人の数奇な物語を告げられる。ユダが探し求めていた「ミルク味の豆腐」、そして「藤井かおり」という少女、果たして少女とユダの関係は、また少女は本当に存在したのだろうか・・・。