米ソ冷戦下。ソビエト海軍は、ソナーに探知されない無音推進装置を装備 した最新鋭ミサイル原潜「レッド・オクトーバー」を完成させていた。これに 乗り込むのは、ベテランの名艦長ラミウス大佐（ショーン・コネリー）。彼の指揮の元、 レッド・オクーバーは処女航海へと出発した。そして、ラミウス艦長以下士官たちの胸には、 ある計画が秘められていた。 ちょうどその頃、ＣＩＡ分析官ジャック・ライアン（アレック・ボールドウィン） も、イギリス情報部からレッド・オクトーバーに関する情報を入手していた...