ベネディクト・プロと東宝の提携により作成された「フランケンシュタイン」シリーズの2作目。最初に大ダコが登場するのは前作『フランケンシュタイン対地底怪獣』のラストシーンで怪物が大ダコに引き込まれたシーンの引きに対応してる（これはインターナショナル版）。そこから冒頭部分で登場した怪物が前作のフランケンシュタインだと思わせるのは巧いやり方。あんなに心優しい怪物が？と言う疑問を呈する事に成功している。そしてそれからの展開が凄い。東宝では基本的に嫌う傾向のある“人を食らう怪獣”を敢えて映し出し、身軽に動き回るフランケンシュタインと、パニックを起こして逃げ回る人の群。

　ステュアート博士やアケミの望みとは裏腹に自衛隊により追いつめられるフランケンシュタイン。ここが又凄い。後の東宝の人間側兵器の代名詞ともなるメーサー車の登場。ここでの自衛隊対ガイラのシーンは特撮映画史に残る最高の出来映えで、作戦を遂行する自衛隊の面々の緊迫感。メーサー車の光線によって木々が折れていくなど、演出面も最高。

　そして現れたサンダの雄々しさと優しさ。兄弟の身を案じ、甲斐甲斐しく介護を務めつつ、人を助ける優しさ。そしてガイラを諫めようと木を引っこ抜いて振り上げた際、無防備なガイラに一瞬の躊躇を見せるシーン。言葉こそ交わすことが無くとも、これだけの演出が出せたのは見事だった。

　そして最後の戦いで、破壊される町並み。サンダとガイラがとにかく素早く動くもんだから（同年に始まったテレビシリーズの『ウルトラマン』より遙かにスピーディ）、ビル群の破壊がとにかく派手で、これ又見事な出来だった。それで二人の戦いは海へと持ち込まれるが、これまた迫力充分。撮影所内の巨大プールを好きに使える東宝の面目躍如と言ったところ。

　ヘリコプターによる爆撃の中、もみ合う二人の怪物の乱闘は最終的に決着が付かず。しかし、これはこれで良かったのではないかな？物悲しい余韻を残してくれた。

　前作『フランケンシュタイン対地底怪獣』と較べ、確かに怪獣のもの哀しさと言う点では劣る感じだが、その分、特撮部分の演出は見事。実際GAINAXの面々もこの演出は随分勉強したらしく、『エヴァンゲリオン』であれ、『ガメラ２』であれ（特技監督の樋口真嗣もGAINAXの一員)、同じような演出がなされていることも。